Sakura Kinomoto é uma garota de dez anos que vive uma vida bem simples e quotidiana. Apesar de ter perdido sua mãe, Nadesiko, muito cedo, Sakura não é uma criança triste. Muito pelo contrário, é alegre, doce, cheia de vida e muito amada por todos que a cercam.
Tudo começa quando Sakura, por acaso, abre um dos livros da biblioteca pessoal do seu pai. Dentro dele, nada mais do que algumas curiosas cartinhas. Sakura, por curiosidade, pega a primeira delas e lê o que estava escrito: WINDY (vento)
Assim que ela diz essa palavra, surge uma ventania repentina que leva todas as cartas embora. Sakura fica apenas com a carta "the windy" na mão.
Mas o que sobra de toda essa confusão não é só a carta. Um bichinho muito estranho também aparece. Seu nome é Kerberus e ele se apresenta como o protetor das cartas Clow (Clow Cards).
Kerberus explica a Sakura que toda essa força mágica agora estava espalhada pelo mundo e, por isso, as cartas deveriam ser resgatadas e trancadas o mais rápido possível, caso contrário, muitas tragédias poderiam acontecer.
A partir daí, Sakura torna-se uma Card Captor e começa sua missão de reunir as cartas. Mas é claro que não o fará sozinha! Além de Kerberus, que Sakura chama carinhosamente de Kero, ela contará com a ajuda da amiguinha, Tomoyo Daidouji, do emburrado Li Shaoran e, somente na versão animada, de Meilin.
Mas não só do ofício de Card Captor que vive a pequena Sakura. Ela também tem que enfrentar o quotidiano da escola. Todos os dias, a menina acaba por adormecer mais do que deveria e quando acorda... é aquela correria! Toma o café da manhã, preparada pelo seu pai Fujitaka, em tempo recorde e apressa-se pra colocar os patins e voar pra escola.
Na realidade, o que ela quer mesmo é alcançar seu irmão mais velho, Touya, a tempo para que assim, ela possa ir pra escola com Yukito, o melhor amigo de Touya.
No colégio, Sakura vive grudada na melhor amiga, Tomoyo, que por sinal é a primeira a saber do segredo das cartas mágica e como é muito rica e cheia de talentos, que se oferece pra confeccionar os uniformes da amiga, além de filmar todas as aventuras. Afinal, segundo ela, Sakura quado pega as cartinhas com aquelas roupinhas cada dia mais fofas fica linda demais pra não ser registrada. Mas Tomoyo não é a única amiguinha de Sakura. Também tem Chiharu, a Rika, o Yamazaki e a Naoko...